肝内胆管结石的病发原因与胆管的病菌感染、裂头蚴感染及胆液停留相关。除此之外，胆液中的黏蛋白、酸碱性黏多糖、人免疫球蛋白等大分子物质，炎症性渗出液，掉下来的鳞状上皮细胞、病菌、裂头蚴、胆液中的金属离子等，均参加结石的产生。
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1、上腹痛，可能为典型性胆绞痛或持续性涨痛，有的病人疼痛不显著，而寒颤发热比较突出，周期时间发病;
2、可有长期性的胆管病历、或伴随寒颤发热、黄疸的急性胆管炎史;
3、患肢肝部及下胸部有习惯性疼痛不适感，常放射性至背、肩膀;一侧肝管梗塞时，可无黄疸或黄疸甚轻;
4、急性症状，可出現亚急性化脓性胆管炎的病症，或不一样水平的Charcot三联征(疼痛、寒颤发热、黄疸)，大部分可能是合拼的肝外胆管结石引发。
5、肝部压疼和敲击痛显著，肝脏呈不对称性肿胀并有压疼。